日本バプテスト連盟医療団は、1954年に米国南部バプテスト連盟に連なる諸教会の献金によって設立された日本バプテスト連盟医療団によって創立されました。その翌年に日本バプテスト病院を開設、さらに看護専門学校や老人保健施設、眼科クリニックなどを併設し、総合的医療施設群として地域医療の発展に貢献してまいりました。当財団の中心的な施設である総合病院では、1995年に京都初の認可施設としてホスピス病棟とNICU（新生児特定集中治療室）を開設。以来、終末期における全人医療の実践とともに、NICU機能を活かした周産期医療に力を入れています。そして2006年には念願の新病院が完成し、MRI検査室をはじめとした最先端の設備器機も完備。患者さまに、よりいっそう快適で安心・安全な医療環境を提供できるものと思います。

1954年（昭和29年）	１月 ３月		日本バプテスト診療所開設 財団法人日本バプテスト連盟医療団設立認可
1955年（昭和30年）	７月 １２月		日本バプテスト病院開設（認可病床数78床） 社会保険診療開始
1966年（昭和41年）	４月		日本バプテスト看護学院（現・看護専門学校）開校
1971年（昭和46年）	１２月		155床の認可を受ける
1995年（平成7年）	９月 ８月 １２月		ホスピス病棟開設 NICU（新生児特定集中治療室）開設 救急告示病院認可 バプテスト訪問看護ステーション開設
1996年（平成8年）	１２月		労災指定病院認可
1998年（平成10年）	７月		ホスピス増床・167床の認可を受ける
1999年（平成11年）	４月 ５月		バプテスト老人保健施設開設 バプテスト眼科クリニック開設
2003年（平成15年）	２月		（財）日本医療機能評価機構による 病院機能評価認定（一般A）病院となる
2005年（平成17年）	１月		病院新館建設許可
2006年（平成18年）	４月		病院新館完成
2008年（平成20年）	2月		（財）日本医療機能評価機構による 病院機能評価（審査体制区分2）Ver.5.0更新
2009年（平成21年）	11月		バプテスト在宅ホスピス緩和ケアクリニック開設